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北京爱思益普在单细胞测序领域建立了基于10x Genomics平台的技术体系，可解析化合物处理后细胞异质性变化。在某抗肿瘤药物研发项目中，单细胞测序技术发现化合物能诱导肿瘤微环境中免疫细胞亚群的重编程，揭示了药物发挥抗肿瘤活性的新机制。该技术平台已支持多个创新药项目进入临床阶段，其中第三代EGFR抑制剂的研发数据直接用于化合物结构优化。
公司开发的空间转录组学技术，通过Visium平台实现组织切片原位基因表达分析。在神经疾病研发中，该技术被用于分析阿尔茨海默病模型小鼠海马体区域的基因表达变化，发现Aβ沉积与神经炎症相关基因的空间共定位，为靶向治疗提供新靶点。这种多维度的技术整合能力，使公司能够从单细胞水平到组织空间维度全面解析药物作用机制。
前沿技术布局还体现在类器官模型的开发上。公司已构建肠道、肝脏、肿瘤等多种类器官培养体系，支持药物毒性评价和疗效预测。在某自身免疫性疾病药物研发中，通过类器官模型评估化合物对肠道屏障功能的影响，其预测结果与临床前动物实验相关性达85%以上。这种技术体系显著降低了研发风险，加速了创新药的转化进程。
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