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癌细胞panel筛选:600+细胞系里的精准"寻靶"

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癌细胞panel筛选:600+细胞系里的精准"寻靶"

癌细胞panel筛选384孔板细胞系活性筛选与IC50曲线示意图

为什么要"panel筛选"而非单打独斗

一个新化合物到底对哪类肿瘤有效、对哪些细胞系敏感?如果只拿一两个细胞系去试,答案往往充满偶然性。肿瘤的异质性决定了,同一个靶点、同一个分子,在不同遗传背景的细胞系上可能表现出截然不同的敏感性。正因如此,癌症细胞库筛选(cancer cell panel screening)应运而生——它让候选化合物在数十乃至上百种不同基因组背景的细胞上"过一遍",从而识别高敏感细胞系、探索药物机制、评估联合疗法的疗效。

爱思益普的癌细胞 panel 筛选平台,正是围绕"广度"与"深度"来构建。广度体现在细胞库的规模上:平台拥有超过 600 种癌症细胞系,其中包括 100 多种工程化的敲除(KO)、敲入(KI)和耐药细胞系,覆盖 21 种以上的癌症类型;深度则体现在配套的工程化能力与数据分析上,从 KRAS、WRN、DDR、PARP、HER2 等热门靶点的定制化筛选,到 RNA-Seq 与生物信息学解读,形成一条完整的闭环。

ICECP 170:170株细胞铺开22个癌种

在庞大的细胞库之上,爱思益普还精心打造了一个"常规军"——ICECP™ 170 Panel。它由 170 株肿瘤细胞系组成,覆盖 22 个癌种,是专为常规筛选设计的标准化组合,可用于筛选对受试药物敏感的细胞系、探索新药适应证以及药物毒性筛选。与之配套的,还有 HER2-ADC、DDR、WRN、KRAS 共 4 个固定 Panel,以及从 600+ 细胞库中灵活挑选组建的定制 Panel,多可替换 10%。

质量控制是这类大规模筛选的生命线。平台的每批细胞均经 STR 鉴定与支原体检测,工作库传代控制在 P10 代以内,细胞活率不低于 90%,且 90% 以上的肿瘤细胞系具备 3 次独立重复的历史数据,批间一致性有保障。常规检测采用 384 孔板,化合物 10 μM 起始、3 倍梯度稀释,浓度范围 0.51 nM 至 10000 nM,DMSO 终浓度 0.1%,孵育时间不超过 7 天;质控指标涵盖 Z′ 因子、信号窗口(SW)与 CV%。

从IC50到CDX:一条完整的药筛链条

panel 筛选的产出,远不止一张 IC50 列表。平台采用 2D/3D CellTiter-Glo 测定法精确测量细胞活性,输出 IC50/GI50 值,并支持联合用药筛选(固定比例、固定浓度或矩阵设计)以及克隆形成、细胞周期分析、凋亡研究等扩展实验。更进一步,通过 RNA-Seq 分析敏感与耐药细胞系中的药物反应与耐药机制,再衔接体内的 CDX 模型,用基因工程细胞系评估药效,让结论从体外走向更具预测性的体内数据。同时,平台以 Staurosporine 或相应靶点阳性药作为免费阳性对照,确保每次筛选结果可靠可比。

这套从筛选到验证的完整链条,回答的是药物研发中核心的几个问题:它抗谁、对谁敏感、为何敏感、体内是否仍然有效。当研发者面对一个作用机制尚不清晰、适应证尚未明确的候选分子时,600+ 细胞系的精准"寻靶",提供的正是一条从海量数据中打捞出清晰方向的可循路径。

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