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细胞的"定制工坊":爱思益普如何用基因编辑技术打造精准筛选工具

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引言

    如果把新药研发比作一场精密手术,那么细胞系就是手术台上的「患者模型」。一个高质量的细胞模型,能让科学家在真正进入人体试验之前,反复验证药物的安全性和有效性。爱思益普的细胞工程平台,正是这样一个「定制工坊」——用基因编辑技术为客户量身打造适合的筛选工具。北京爱思益普生物科技股份有限公司自 2010 年创立以来,始终聚焦这一核心环节,构建了覆盖基因编辑、稳转细胞系构建、功能基因组学筛选的全链条细胞工程服务体系。


一、为什么需要“定制细胞”?

    传统的药物筛选通常使用现成的商业细胞系,但这些细胞系往往存在几个问题:

    💧 ,表达水平不稳定——同一批细胞,有的表达靶蛋白多,有的表达少,导致实验结果难以重复。

    💧 第二,遗传背景复杂——很多癌细胞系积累了大量突变,干扰了药物效果的准确评估。

    💧 第三,缺乏特异性——对于某些罕见靶点或新兴靶点,市面上根本找不到合适的细胞模型。

    爱思益普的细胞工程平台,通过基因编辑技术为客户「定制」细胞系,解决这些痛点。截至 2025 年,平台已累计建立超过 1500 种靶点蛋白和细胞系,涵盖Reporter 细胞系、Ba/F3 稳转细胞系、HiBiT 稳转细胞系等多样化模型,为信号通路研究、靶向药物开发及 PROTAC 技术验证提供了关键工具。


二、三大基因编辑技术:质粒、慢病毒与 CRISPR

    爱思益普采用三种主流技术路线构建工程化细胞系,每种技术各有特点,适用于不同场景:

    💊 质粒介导的过表达是经典的方法。科学家将目标基因的 DNA 序列插入质粒载体,通过电穿孔或化学转染的方法将质粒送入细胞。质粒在细胞中暂时存在,表达目标蛋白。这种方法操作简单、成本低,适合短期实验。但质粒会逐渐丢失,表达水平不稳定,不适合长期筛选。

    💊 慢病毒介导的过表达则解决了稳定性问题。慢病毒能将目标基因的 DNA 整合到细胞基因组中,实现永久表达。即使细胞分裂,基因也会传给子代细胞。爱思益普的慢病毒系统效率高,能感染分裂和非分裂细胞,适合构建需要长期稳定表达的细胞系。


    💊 CRISPR/Cas9 基因编辑是当前精准的基因编辑技术。它像一把「分子剪刀」,能在基因组的特定位置切割 DNA,实现基因敲除、点突变或基因敲入。爱思益普利用 CRISPR 技术,不仅构建了 500 余株基因编辑细胞系,还开发了GeCKO v2.0 全基因组 CRISPR 敲除文库,支持功能基因组学筛选。


    在某 PROTAC 项目中,客户需要评估化合物对 STAT6 蛋白的降解活性。爱思益普通过 CRISPR 技术,在细胞基因组的 AAVS1 安全港位点精准敲入 HiBiT 荧光报告基因,构建了 STAT6-HiBiT 稳转细胞系。结合高通量筛选系统,成功评估了数十万种化合物的降解活性,使研发周期缩短了 40%


三、Reporter 细胞系:让药物效果“看得见”

    Reporter 细胞系是药物筛选中的「信号灯」——当药物作用于靶点时,细胞会发出可检测的信号(如荧光、发光),让科学家直观看到药物效果。

    爱思益普构建了多种类型的 Reporter 细胞系荧光素酶报告基因系统将靶基因的启动子与荧光素酶基因连接,当药物激活或抑制靶基因时,荧光素酶表达量变化,可通过化学发光检测仪定量。GFP/mCherry 荧光蛋白系统则可直接观察蛋白的定位和表达变化,适合研究药物对蛋白转运、降解的影响。

    HIBIT 技术是爱思益普的特色平台之一。HiBiT 是一个 11 个氨基酸的小标签,能与互补的 LgBiT 片段结合,产生明亮的发光信号。通过 CRISPR 技术将 HiBiT 标签敲入内源性基因位点,可以在不干扰蛋白功能的情况下,实时监测蛋白的表达和降解。这一技术在 PROTAC 药物筛选中尤为重要——科学家可以精确看到化合物诱导靶蛋白降解的动力学过程。

    在某 BRAF V600E 突变黑色素瘤项目中,平台对同一批化合物进行三次独立筛选,IC50 值重复性误差小于 15%,为后续药物优化提供了坚实数据支持。这种高重复性正是 Reporter 细胞系标准化构建的优势体现。


四、Ba/F3 稳转细胞株:激酶药物的“试金石”

    Ba/F3 是一种小鼠原 B 细胞系,其生长依赖 IL-3 细胞因子。科学家可以将人源激酶基因导入 Ba/F3 细胞,使其转变为依赖该激酶信号存活的状态。当激酶抑制剂阻断信号时,细胞停止生长或死亡——这种“生存依赖”的特性,使 Ba/F3 成为激酶药物筛选的理想模型。

    爱思益普构建了覆盖多种激酶靶点的 Ba/F3 稳转细胞株库。这些细胞株经过严格验证,确保激酶表达水平稳定、信号通路功能正常。在筛选实验中,平台通过检测细胞增殖(如 CellTiter-Glo 方法)或细胞存活(如流式细胞术),定量评估化合物对激酶的抑制活性。

    Ba/F3 模型的优势在于其“纯净”的遗传背景——细胞本身突变少,干扰因素少,药物效果更容易解读。同时,由于细胞依赖单一激酶信号存活,可以明确判断药物是否真正靶向该激酶,而非通过其他途径间接影响细胞。


五、CRISPR 文库筛选:从「单点突破」到「全局扫描

    传统的药物筛选通常是「单点突破」——针对一个已知靶点,测试化合物是否有效。但很多时候,科学家并不知道哪个靶点才是治疗疾病的关键。这时候,就需要「全局扫描」——同时检测成千上万个基因的功能,找出与疾病相关的关键靶点。

    爱思益普的 GeCKO v2.0 全基因组 CRISPR 敲除文库,覆盖了人类基因组中绝大多数编码基因和 miRNA。每个基因对应多个 sgRNA(单链向导 RNA),确保敲除效率。文库以慢病毒形式交付,感染细胞后实现全基因组范围的基因敲除。

    筛选流程通常是这样的:将 CRISPR 文库感染肿瘤细胞,给予药物处理,存活下来的细胞就是“抗性细胞”。通过高通量测序,分析这些细胞中哪些sgRNA富集——对应的基因就是药物敏感性的关键调控因子。反之,在药物处理下死亡的细胞中,哪些 sgRNA depleted——对应的基因可能是药物发挥作用的协同靶点。

    这种“正向遗传学”筛选策略,不依赖于对靶点的先验知识,能够发现全新的药物靶点和耐药机制。在某抗肿瘤药物耐药机制研究中,平台通过 CRISPR 文库筛选,发现了多个与耐药相关的基因,为克服耐药提供了新靶点。


六、高内涵成像与 FACS:细胞筛选的“火眼金睛”

    构建好细胞系后,如何高效筛选出符合要求的克隆?爱思益普采用高内涵细胞成像系统和荧光激活细胞分选(FACS)技术,实现精准筛选。

    高内涵成像系统像一台「智能显微镜」,能在保持细胞活性的同时,自动拍摄大量细胞的图像,并通过人工智能算法分析细胞形态、蛋白定位、信号强度等参数。在稳转细胞系构建中,系统可以快速识别高表达靶蛋白的克隆,大幅提高筛选效率。

    FACS技术则像一台「细胞分拣机」。细胞经过荧光标记后,通过流式细胞仪逐个检测。符合标准的细胞(如高表达 GFP)被电荷偏转,收集到特定容器中;不符合标准的细胞则被丢弃。这种单细胞分选技术,确保了终获得的细胞系来自单一祖先细胞,遗传背景均一。

    在某基因编辑项目中,平台通过 FACS 分选,从数万个细胞中筛选出 5 个高潜力克隆,经 NGS 测序验证,全部携带预期的基因突变,编辑效率达 100%。


七、从细胞工程到药物发现:一体化闭环

    爱思益普的细胞工程平台并非孤立存在,而是与靶点筛选、体外药效评价、体内药效验证、DMPK、安全性评价等平台有机整合,形成从细胞模型构建到临床前候选分子确定的一体化服务体系

    在靶点验证阶段,平台通过 CRISPR 技术构建靶点敲除/敲入细胞系,验证靶点与疾病的相关性。在先导化合物筛选阶段,利用 Reporter 细胞系和 Ba/F3 细胞株,快速评估化合物活性。在临床前候选分子优化阶段,通过基因编辑构建耐药细胞系,预测临床耐药风险,指导结构优化。

    目前,平台已支持全球药企完成数十项项目的 IND 申报,每年有数百个项目进行新药临床研究申报。这种“从细胞到临床”的闭环服务体系,显著提高了新药研发的效率和成功率。


八、面向未来:AI 驱动的细胞工程新纪元

    面对人工智能和自动化技术的快速发展,爱思益普正积极推进细胞工程的数字化转型。平台整合机器学习算法与高内涵成像数据,实现细胞表型的智能识别和分类。在自动化实验系统方面,平台升级了液体处理机器人、自动化细胞培养系统和数据分析平台,实现从基因编辑到克隆筛选的全流程自动化。

    此外,平台还在拓展新兴细胞模型领域,包括类器官、器官芯片、3D 细胞球等。这些模型比传统 2D 细胞培养更贴近体内真实环境,能更好地预测药物的临床效果。爱思益普凭借在细胞工程领域的深厚积累,正在建立针对这些新兴模型的构建和评价能力。